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第一,在肝微粒体、肝细胞体外代谢模型中,孵育时间需设置合理,这个合理是基于人体肝微粒体或者肝细胞稳定性的结果而设定的。如果体系孵育时间过长或过短,则可能引起代谢产物种类和量偏少或偏多,这对最终判定一个代谢产物的比例或结果起绝对性的一个作用。
第二,在体外和体内代谢产物鉴定试验中,如有紫外检测器和质谱检测器数据,通常需要把两者结合在一起分析,大部分情况下两者的信号能够匹配。但是紫外检测器和质谱检测器的特点不同,质谱检测器相对而言灵敏度更高。而对一些含量相对比较低的代谢产物,紫外检测器可能检测不到。
第三,在代谢产物的结构、母核类似的情况下,代谢产物间的紫外强度数据可能比质谱检测数据更可靠。